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DF-1细胞中与鸡BRD2相互作用细胞蛋白的筛选及功能分析

2021-07-02     浏览次数: 47

     2021年6月30日,实验室段志强副教授课题组在国际学术期刊British Poultry Science在线发表了Screening and bioinformatics analysis of cellular proteins interacting with chicken bromodomain-containing protein 2 in DF-1 cells(JCR三区,IF:2.095),论文链接https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/00071668.2021.1943311。

溴结构域包含蛋白2(bromodomain-containing protein 2, BRD2)是BET家族蛋白成员之一,也是第一个被鉴定的哺乳动物BET基因。近年来的研究结果表明,BRD2在基因转录调节、细胞周期、神经发育、细胞炎症、脂肪生成、病毒复制等方面具有重要作用。2006年,国外有研究人员通过免疫共沉淀结合蛋白质谱鉴定的方法,鉴定许多与人BRD2蛋白相互作用的细胞蛋白,包括染色质相关蛋白、转录激活相关蛋白和细胞周期调节相关蛋白。由于鸡与人BRD2蛋白的同源性较低(77.5%),两者是否有相似的细胞生物学功能尚不清楚。

该课题组将构建的鸡BRD2基因重组真核表达载体转染DF-1细胞,利用免疫共沉淀结合蛋白质谱鉴定的方法,共筛选到225个与鸡BRD2相互作用的细胞蛋白,主要涉及基因的转录调节、细胞周期、生长发育、代谢与生物调节等生物学过程。KEGG分析结果显示,这些相互作用的细胞蛋白主要涉及遗传信息过程、翻译过程、免疫系统和细胞发育等信号通路。通过荧光共定位和免疫共沉淀试验证实鸡BRD2与核基质蛋白3(matrin 3)在细胞核中存在相互作用。以上研究结果为后续深入探讨鸡BRD2的生物学功能以及在家禽病毒感染中的作用奠定了重要工作基础。

 

图1 与鸡BRD2相互作用细胞蛋白的GO功能注释

 

图2 与鸡BRD2相互作用细胞蛋白的KEGG分析

 

 

图3 蛋白质相互作用网络图分析

 



(图/文:段志强)


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